Для этого нам необходимо посмотреть какие файлы являются не исполняемыми.
Вот так это делается:

find -type f -name '.sh' ! -executable

Если необходимо стать владельцем файлов:

chown -R 1000:1000 '/путь/до/директории'

Сделать все файлы .sh исполняемыми:

find -type f -name '.sh' -exec chmod +x {} +